Transcript презентация

Онлайн BLAST
С.А.Спирин, Ю.А.Пеков
Москва, 21 октября 2014
Пять видов бласта
Программа Запрос
Банк
BLASTN
НК
НК
BLASTP
Белок
Белки
BLASTX
НК
Белки
TBLASTN
Белок
НК
TBLASTX
НК
НК
Два воплощения бласта
Онлайн
Локальный
(standalone)
Веб-интерфейс на сайте NCBI
Список банков
Ограничение поиска организмом или таксоном
Выбор варианта BLASTN (по умолчанию стоит megablast)
Три вида blastn
Программа
Затравка (в
онлайнверсии)
28 нк
Цели
discontiguous
megablast
11 нк
Близкие
гомологи
blastn
11 нк
Любые
гомологи
megablast
Очень близкие
гомологи
Дополнительные параметры
Дополнительные параметры
Эти параметры
часто приходится
задавать